软件学习
Avogadro
Gromacs
Gaussian
Materials studio
LAMMPS
LAMMPS

  • LAMMPS讲解79-LAMMPS的一个时间步是如何工作的

    理解LAMMPS代码工作方式的第一也是最基础的方法就是明白一个时间步使如何执行的。一个时间步是通过调用Updata类中的积分类实例的方法来实现。Modify类存储了所有的Fix对象，以及一个列表来记录在时间步的哪个阶段调用哪个fix。Fix是LAMMPS中用来针对一个模拟来在一个时间步内实现某种操作。LAMMPS会通过Neighbor类中的build()方法来重建邻居列表。

    2023-02-23 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解78-LAMMPS实现小分子有机半导体的沉积结果分析

    尽管并五苯分子仍平行于基底，但是SAM的加入能使并五苯分子取向更加有序。粗糙SAM和粗糙SAM表面上不同分子层的质心高度随沉积分子数的变化。结果表明，粗糙度会引起表面自由能的变化，从而调控了有机半导体分子沉积的动力学行为。

    2023-02-23 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解77-LAMMPS实现小分子有机半导体的沉积模拟结果

    感谢鲍路瑶老师的分享，内容来自于鲍老师分享出来的资料如有需要添加微信：lmp_zhushou 进入微信群，帮助他人，共建社区获取完整版lammps讲义可以加微信lmp_zhushou或加入QQ群994359511本节作者Lethe同学，感谢他的贡献

    2023-02-23 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解76-LAMMPS实现小分子有机半导体的沉积模拟过程

    具体的in文件如下： ######################### ## #### Pentacene in file #### ######################################################## Initial setup ###########

    2023-02-23 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解75-LAMMPS实现小分子有机半导体的沉积建模细节

    我们使用Materials Studio 分别构建了两种不同表面形貌的Au基底，其中粗糙基底是由光滑基底切割而来的，其模型尺寸为105 105 ，同时，对于两种Au表面分别覆盖了两种极性差异极大的SAMs分子，分别为SAM和SAM分子，不同的末端官能团展现出明显的极性差异，这可能对有机半导体的沉积造成一定的影响。沉积所使用的小分子有机半导体为pentacene。

    2023-02-23 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解74-LAMMPS实现小分子有机半导体的沉积研究背景

    有机薄膜晶体管是一种用有机半导体制备的有机电子器件，广泛应用于有机传感器、存储器件和柔性电路等领域。在OTFT中（图1），有机半导体分子需要站在基底上，这就保证了有机半导体之间的p键方向垂直于表面。图1 有机薄膜晶体管示意图；有序的DNTT层状薄膜示意图。

    2023-02-23 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解73-耗散粒子动力学滑移边界条件控制方法

    耗散粒子动力学在复杂流动方面具有广泛的应用。本例通过修改LAMMPS源代码中的fix wall和fix wall/lj126实现了文献Tunable-slip boundaries for coarse-grained simulations of fluid flow中的滑移边界条件控制方法。耗散力用来控制速度，随机力和耗散力组合起来保证近壁区的温度不变。其中γ_WT为控制强度，调节该值的大小就可实现滑移量的控制。

    2023-02-21 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解72-耗散粒子动力学简单流动

    耗散粒子动力学是专为流体而开发的介观粗粒化模拟方法。这也是耗散粒子动力学的名字的由来。在LAMMPS中主要通过pair dpd进行基础或原始耗散粒子动力学模拟。因此在耗散粒子动力学中系综一定要采用fix nve。耗散粒子动力学最简单的例子就是模拟通道流，即两无限大平行平板间的层流现象。在耗散粒子动力学中比较重要的是边界条件的设置。

    2023-02-21 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解71-ReaxFF力场验证

    ReaxFF已经存在很多元素的力场参数。很多时候能够找到包含所需元素的力场参数。但是力场参数往往是根据特定体系而开发的，是否适用于自己的体系则需要验证力场参数。验证力场参数的基本流程就是对比自己体系中的分子各种能量（如键，键角，二面角）与DFT计算的能量。如果吻合较好那么找到的力场参数就可以用，如果不好就要基于找到的力场参数进行进一步优化。本节介绍力场参数的验证过程。严格的验证力场需要对比各项能量和参数，包括键结、非键结和电荷平衡参数。（1）电荷平衡参数验证这个可以通过计算一个完整分子和分子片段内原子的电

    2023-02-21 0 0 0 0

  • LAMMPS讲解70-GARFfield基本使用

    使用GARFfield需要准备几个输入文件。而GeoFile文件就是提供这一作用。所有涉及到的单位都和LAMMPS中的real单位系统一致。参数文件确定哪些力场参数会被GARFfield优化。由于GARFfield通过所选择的力场引擎来进行几何优化，因此必须采用相应的约束来使得结构不会偏离想要的反应路径。GARFfield的输出信息：当GARFfield开始的时候，它会向终端

    2023-02-21 0 0 0 0
共有8页首页上一页12345678下一页尾页
技术支持： CLOUD | 管理登录
seo seo