如图，选中了框想把他去除然后delete就好了
3，检验是否安装完成。此处/usr/local/gromacs/bin/GMXRC路径是因为我们安装gromacs时没有指定安装路径，系统默认可执行文件放在/usr/local/bin当中。
一旦选定了一个平面，就可以通过单击原子并拖动来操纵平面两端的原子。显示的角度会自动调整，选择的键长不会改变。左键点击一个取代基，或者在这个例子中，一个氢和一个选定的碳原子成键，就可以调整扭转角度。
Bond-Centric Manipulate tool可以改变分子的角度、键和扭转。·单击一个键并拖动光标可以调整平面。如果勾选了“Snap-to Bonds”，你会注意到平面在旋转时从黄色变成了蓝色。“Snap-to Threshold” 决定了一个平面与相邻键平面之间的夹角。例如，下面所示的“Snap-to Threshold”是10度。将Snap-to Threshold更改为90度是旋转平面只对相邻键平面进行snap的快速技巧。
导航工具用于平移、旋转和缩放分子的视图。如果选中“Display visual cues”框，黄色箭头将显示正在进行的导航类型。点击黑色显示屏上的任何地方并拖动鼠标，整个分子就会倾斜并旋转(如下图所示)。一个分子也可以通过点击原子并拖动鼠标来绕原子旋转。如下图所示，丙酮围绕其初始碳旋转。右击可以改变分子在显示屏上的位置。双击该分子将重置该分子的视图。使用鼠标的中间滚动条可以让你放大和缩小。
您可以输入“O”，或者从下拉菜单中选择“Oxygen ”，然后单击黑色显示。
通常，选择工具允许对原子、键或片段进行单独的选择。有三种选择模式: “Atom/Bond”, “Residue”, 和“Molecule”.“Atom/Bond”选择模式为您提供了在分子中选择单个原子的能力。右击黑色显示将清除所做的选择。“Residue”选择模式选择一个分子内的整个残基。单击和拖动光标是选择分子或分子碎片的另一种方式。
开始绘制“O-C-O”结构。结构画好后，你所要做的就是点击左键。左键点击将创建一个双键(如图所示)。一旦你创建了你的分子，你可以通过extensions menu优化它的几何形状。选择“Extensions”菜单，并点击“Optimize Geometry”将为您的分子提供适当的键长和角度。现在你已经掌握了在Avogadro画分子的基本知识!
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