Gromacs_软件学习_分子模拟小破屋

软件学习

Avogadro

Gromacs

基础命令
基础教程
mdp

Gaussian

Materials studio

LAMMPS

Gromacs

Gaussian 讲解10-密度拟合基组

Gaussian 09对纯DFT计算提供密度拟合近似[Dunlap83, Dunlap00]。Gaussian 09能从AO基自动产生合适的拟合基，用户也可以选择一套内置的拟合基组。在Gaussian 09中可以使用以下的拟合基组关键词： u DGA1和DGA2 [Godbout92, Sosa92]。u QZVP [Weigend03, Weigend05]，对应于QZVP基组。u Ahlrichs及其合作者的W06拟合集[Weigend05, Weigend06]。u NoFit：关闭用于该计算的拟合集。该关键词用于将Default.Route文件覆盖DensityFit 关键词。

2023-03-03 0 0 0 0
Gaussian 讲解09-纯基函数与笛卡尔基函数产生的问题

关于纯基函数与笛卡尔基函数，Gaussian 用户应当知道以下几点： u 所有的内置基组使用纯 f 函数。u 在一个 Gaussian 计算中，所有的 d 函数必须都是 5D 或 6D，所有的 f 以及更高的函数必须都是纯函数或笛卡尔函数。类似地，如果对在执行路径部分定义 6-31G基组的任务，用 ExtraBasis 为过渡金属添加来自 6-311G基组的基函数，将使用笛卡尔 d 函数。

2023-03-03 0 0 0 0
Gaussian 讲解08-有关基组的其它关键词

下面这些有用的关键词与基组关键词一起使用： u 5D 和 6D：分别使用 5 或 6 个 d 函数。u 7F 和 10F：分别使用 7 或 10 个 f 函数。它们也用于更高的函数。使用ExtraBasis和Gen关键词，可以为程序输入其它的基组。ChkBasis关键词表示基组从检查点文件读取。详见本章后面关于这些关键词的单独说明。

2023-03-03 0 0 0 0
Gaussian 讲解07-添加极化和弥散函数

对重原子添加 3 套 d 函数和一套 f 函数，对氢原子添加两套 p 函数。例如，AUG-cc-pVTZ 基组为氢原子添加一个 s，一个 p 和一个 d 弥散函数，为 B-Ne 和 Al-Ar 的原子添加一个 s，一个 p，一个 d 和一个 f 弥散函数。下面的表列出了 Gaussian 09 中每种内置基组的极化和弥散函数，以及应用范围：

2023-03-03 0 0 0 0
Gaussian 讲解06-基组

u CEP-31G：Stephens/Basch/Krauss 的 ECP 分裂价基组[Stevens84, Stevens92, Cundari93]。

2023-03-03 0 0 0 0
Gaussian 讲解05-模型化学

方法和基组的组合定义一个Gaussian的模型化学，也就是定义理论级别。有些使用密度泛函方法的任务还可以包含密度拟合基。下表列出了Gaussian使用的方法，以及每种方法可用的任务类型。l ONIOM 和 IRCMax 的任务需要多种方法的说明。l 前面提到的模型 2//模型 1 的形式，可用于在几何优化之后，自动在优化的结构上进行单点能计算。

2023-03-03 0 0 0 0
Gaussian 讲解04-Gaussian 09 任务类型

Gaussian 09 输入文件的执行路径部分定义了执行的计算类型。这部分内容有三个关键部分： u 任务类型 u 计算方法 u 基组下面的表列出了 Gaussian 09 中可以使用的任务类型：一般而言，只能指定一种任务类型关键词。注意 Opt Freq 计算不能使用此语法。预测分子特性下面的表格给出了常用预测量与产生这些量的 Gaussian 09 关键词之间的对应关系：

2023-03-03 0 0 0 0
Gaussian 讲解03-输入语法

一般情况下，Gaussian 输入遵循下面的语法规则： u 自由格式输入，且大小写无关。u 在整个 Gaussian 09 系统中，所有的关键词和选项都可以简化为最短的可区分的缩写形式。无论 Conventional 和 Convergence 是否都是给定关键词的有效选项，都要遵守这一规则。u 在 Gaussian 09 输入文件中，可以包含外部文件内容，使用的语法为：@文件名。

2023-03-03 0 0 0 0
Gaussian 讲解02-Gaussian 09 输入部分的顺序

2023-03-03 0 0 0 0

共有16页首页上一页 12 13 14 1516下一页尾页

电话直呼