详细内容

Gaussian 讲解71-Gaussian 09 IRCMax

说明  

使用 Petersson 及合作者[Eyring35, Truhlar70, Truhlar71, Garrett80, Skodje82, Malick98, Petersson98, Schwartz98,  Petersson98a]的方法进行 IRCMax 计算。这一计算类型用过渡结构做为输入,用 GS2 算法沿着 指定的反应路径寻找最大的能量[Gonzalez89, Gonzalez90](细节参见 IRC=GS2)。 

必须用标准方法为 IRCMax 任务指定可选的同位素。 


必需的输入  

IRCMax 需要两个模型化学作为选项,中间用冒号隔开:IRCMax(模型 2:模型 1)。这 里是一个执行路径的例子:

# IRCMax(B3LYP/6-31G(d,p):HF/6-31G(d,p))  

这个计算在 HF/6-31G(d,p)反应路径上寻找点,该点使 B3LYP/6-31G(d,p)能量位于最大 值。 

选项 Zero 产生用于零曲率变分过渡态理论(ZC-VTST[Eyring35, Truhlar70, Truhlar71, Garrett80,  Skodje82, Petersson98]的数据。考虑下面的执行路径: 

# IRCMax(MP2/6-311G(d):HF/6-31G(d),Zero,Stepsize=15,CalcAll)  

这个任务将从 HF/6-31G(d)过渡态开始,沿着 HF/6-31G(d)IRC 以步长 0.15 amu1/2 Bohr 行寻找,直到找到 MP2/6-311G(d)能量的最大值(含 HF/6-31G(d)零点能)为止。对 MP2/6-311G(d)过渡态沿着 HF/6-31G(d)IRC 进行优化。用 ZC-VTST 版本绝对速率理论进 行反应速率计算所需的全部量都包含输出中:过渡态的转动惯量,所有的实振动频率 HF/6-31G(d)),隧穿的虚频(拟合到 MP2/6-311G(d),加上 ZPE),以及过渡态的 MP2/6-311G(d)加上 ZPE 的总能量。注意,如果未使用 CalcAll,那么所有这些量(ZPE,频 率,等)只在 HF/6-31G(d)级别进行计算,并且这些量用于 IRCMax 路径上所有的点。 


ZC-VTST 选项  

Zero       IRCMax 计算中包含零点能。 


选则路径选项  

Forward       只沿着反应路径的正向进行跟踪。 

Reverse       只沿着反应路径的反向进行跟踪。 

ReadVector     读入矢量进行跟踪。格式为 Z-矩阵(FFF(I), I=1,NVAR),以(8F10.6)读入。 

MaxPoints=N     沿反应路径进行检查的点数(沿着正反两个方向,如果计算中都考虑的话)。 默认是 6。 

StepSize=N     反应路径上的步长,单位是 0.01 amu1/2-Bohr。默认是 10。 

MaxCyc=N      设定每个几何优化中的最大步数。默认是 20。 


选择坐标系的选项  

MassWeighted    跟踪质量加权内坐标(Z-矩阵)的路径(和跟踪质量加权笛卡尔坐标的路径 是等价的)。MW MassWeighted 的同义词。这是默认选项。 

Internal       跟踪内坐标(Z-矩阵)路径,不使用质量加权。 

Cartesian      跟踪笛卡尔坐标路径,不使用质量加权。 


收敛有关的选项

VeryTight    在反应路径每一点的优化中,使用严格的收敛标准。该选项对反应路径上很 小的步长是必要的。 


产生初始力常数选项 

CalcFC        指定在第一个点计算力常数。 

CalcAll        指定在每一个点计算力常数。在路径上的每一优化点,对运动计算投影的振 动频率[Baboul97]。注意,这些投影的振动频率仅对质量加权内坐标的反应路径 计算有效。

FCCards        指定从分子说明后面的输入串读入笛卡尔坐标的力和力常数。该选项使用内 部命令 FCList,可以从 Quantum Chemistry Archive 读取力常数。输入的格式 为: 

               能量 (格式 D24.16) 

              笛卡尔力 (格式为 6F12.8 的几行) 

             力常数 (格式为 6F12.8 的几行) 

           力常数为倒三角形式:((F(J,I),J=1,I),I=1,3Natoms),其中 3Natoms 是笛卡尔坐标 数量。如果同时指定 FCCards ReadIsotopes,则在能量,笛卡尔梯度和/ 或笛卡尔力常数之前输入原子量。 

ReadIsotopes   该选项允许指定不同于默认值(分别为 298.15 K,1 大气压,无换算,和最 丰同位素)的温度,压强,频率换算因子,和/或同位素。该选项可用于重新 进行分析,但使用不同于检查点文件数据的参数。  

           但是需要注意,所有这些参数也可以在执行路径部分(关键词 TemperaturePressure,和 Scale)和分子说明部分(Iso=参数)指定,如这个例子:  

             #T Method/6-31G(d) JobType Temperature=300.0 ...  

             ...  

             0 1  

             C(Iso=13)  

             ...  

           ReadIsotopes 输入具有下面的格式:  

           temp pressure [scale]      数值必须为实数。 

           原子 1 的同位素质量  

           原子 2 的同位素质量 

           ...  

           原子 n 的同位素质量 

           其中的temppressure,和scale分别为所需的温度,压强,和当用于热化学 分析时可选的频率数据换算因子(默认不换算)。其余的行是分子中各原子 的同位素质量,按照分子说明部分出现的相同顺序排列。如果原子量指定为 整数,程序将自动使用相应的真实同位素质量(例如,对18O指定为18,那么 Gaussian使用的值为17.99916)。  


重新开始选项  

Restart     重新开始没有完成的 IRCMax 计算,或对已完成的 IRCMax 计算在反应路径 上加入新的点继续计算。 


适用性 

对计算的 IRC 部分(上面的模型 1)需要解析梯度。对模型 2 可以使用任何非复合的能 量方法和基组。 


有关的关键词 

IRCOptFreq



最新评论
请先登录才能进行回复登录
技术支持: CLOUD | 管理登录
seo seo