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Gaussian 讲解63-Gaussian 09 Freq(1)

说明  

这个计算类型关键词用于计算力常数及其振动频率。另外还计算强度。如果可能,默认 用解析方法计算力常数(对 AM1,PM3,PM3MM,PM6,PDDG,RHF,UHF,MP2,CIS,所有的 DFT 方法,以及 CASSCF),对只有一阶导数的方法(MP3,MP4(SDQ),CID,CISD,CCD,CCSD, BD,QCISD) 默认计算一阶数值差分,对只有能量的方法计算二阶数值差分。

确定能量在笛卡尔核坐标下的二阶导,并变换到质量加权坐标,接下来计算振动频率。 这一变换只对驻点的计算有效!因此,对计算频率所用的方法非驻点的结构,进行频率计 算是毫无意义的。  

例如,在 6-31G(d)优化的结构用 6-311G(d)计算频率将会产生无意义的结果。同样,在 用全部电子关联方法优化的结构上,用冻芯关联方法计算频率,或是相反,都是不正确的。 推荐的方法是在前一个几何优化的结构上,使用同样的方法进行频率计算。这通过在任务的 执行路径部分同时指定 Opt Freq 自动完成。 

还要注意,如果存在一个相同自旋多重度的能量较低波函,用于计算解析频率的 CPHF (耦合微扰 SCF)方法没有物理意义。可以用 Stable 关键词测试 Hartree-Fock 和 DFT 波函 的稳定性。

频率计算的变化  

在频率计算过程中,可能还会计算其它的有关特性,包括:  

当计算解析频率时,自动计算极化率;当进行数值差分时(或者使用了 Freq=Numer), 要计算极化率必须用 Polar 关键词定义(例如,CCSD Freq Polar)。  

VCD 选项除了在 Hartree-Fock 和 DFT 级别进行简正频率分析之外,还可用于计算振动 圆二色性(VCD)的强度[Cheeseman96a]。  

ROA 选项计算解析拉曼光活性强度[Helgaker94, Dukor00, Ruud02a, Barron04, Thorvaldsen08,  Cheeseman09]。  

计算预共振拉曼强度可以指定 Raman 的一个选项,在执行路径中加上 CPHF=RdFreq,并 在输入文件中指定所要的频率(关于附加信息参见例子)。  

含频极化率和超极化率的计算需要在执行路径内加上 CPHF=RdFreq 选项(受所用方法的 限制)。  

可以用 Freq=VibRot 计算振转耦合[Califano76, Miller80, Papousek82, Clabo88, Page88, Adamo90,  Miller90, Page90, Barone03]。如果还指定了 Anharmonic [Adamo90, Barone94, Minichino94, Barone95,  Barone03],还可以沿着振动模式执行数值差分,计算零点能,非谐频率[Califano76, Miller80,  Papousek82, Clabo88, Page88, Miller90, Page90, Barone04, Barone05],和非谐振转耦合。该选项只能 用于具有解析二阶导的方法:Hartree-Fock,DFT,CIS,和 MP2。  

有几个选项用于执行 Franck-Condon 和/或 Herzberg-Teller 方法的电子激发分析(见 下)。  

Opt=CalcAll 关键词需要在几何优化的每一点进行解析二阶导计算。一旦完成所需的优 化,可以得到频率分析的所有必需信息。于是执行频率分析,并把频率任务的计算结果存档。   

选择简正模式的输入 

这些部分指定 SelectNormalModesSelectAnharmonicModes,和 SelectFranckCondonModes 选项输入部分的格式。选择的模式在以空行做为结束的另一输入 部分指定。最初的模式列表总是空的。  

不加关键词的整数和整数范围被解释为模式编号,虽然也可以用[not]mode 关键词。关 键词 atoms notatoms 可用于定义原子列表,分别表示包含/排除这些原子的模式。通过 [not]layer 关键词,还可以用 ONIOM 层指定原子,它接受以下的值:real 表示真实体系, model 表示两层 ONIOM 的模型体系,middle 表示三层 ONIOM 的中间体系,small 表示三层 ONIOM 的模型体系。类似地可以用 residue notresidue 包含/排除原子,它接受残基名称 或编号的列表。两套关键词的作用都是对原子列表使用简化形式。  

这里有一些例子:

2-5               包含模式 2 到 5  

atoms=O            包含涉及氧原子的模式  

1-20 atoms=Fe        包含模式 1 到 20,以及任何涉及铁原子的模式  

layer=real notatoms=H  在低层包含重原子的模式(受默认阈值献之)  

请求特定特性/分析的选项  

Raman      除 IR 强度之外,还计算拉曼强度。这对 Hartree-Fock 频率计算是默认的。 还可指定用于 DFT 和 MP2 计算。对于 MP2,用偶极导数关于电场的数值差分 方法产生拉曼强度(等价于 NRaman)。 

NRaman     通过解析偶极导数对电场的数值差分,计算极化率导数。这对MP2 Freq=Raman 计算是默认的。  

NNRaman    用解析极化率对核坐标的数值差分方法计算极化率导数。  

NoRaman    在 Hartree-Fock 解析频率计算过程中,跳过计算拉曼强度所需的额外步骤, 可节省 10-30%的 CPU 时间。 

VCD       除进行简正频率分析之外,还计算振动圆二色性(VCD)强度。该选项用于 Hartree-Fock 和 DFT 方法。这个选项还计算旋光性(参见 Polar=OptRot)。 

ROA       用 GIAO 计算动态解析拉曼光活性强度。这个流程需要在输入中提供一个或多 个入射光频率,用于电磁微扰计算(CPHF=RdFreq Freq=ROA 的默认设置)。 该选项对 Hartree-Fock 和 DFT 方法有效。NNROA 表示使用 Gaussian 03 的数 值 ROA 方法;它只是用于重复以前计算的结果。  

VibRot     分析振转耦合。  

Anharmonic  沿着模式进行数值差分,计算零点能和非谐频率,如果指定了 VibRot,还计 算非谐振转耦合。这个选项只能用于有解析二阶导的方法:Hartree-Fock, DFT,CIS 和 MP2。  

ReadAnharm  从输入部分读取附加参数,(根据 VibRot Anharmonic 选项)进行振转耦 合和/或非谐振动分析。可用的输入选项参看下面的例子。  

SelectAnharmonicModes   

          读取输入部分,选择哪些模式用于非谐分析中的差分计算。输入部分格式的 说明见上。SelAnharmonicModes 是该选项的同义词。 

Projected   对于质量加权的反应路径(IRC)上的一点,计算振动垂直于路径的投影频率。 在投影中,梯度用来计算路径的切线。注意该计算对结构和路径的精度非常 敏感[Baboul97]。因此,结构至少应定义五位有效数字。该计算在最小值处没 有意义。  

HinderedRotor

         在谐振分析中,要求识别内转动模式[McClurg97, Ayala98, McClurg99]。如果有模式 被识别为受阻的或自由的内转动,则校正热动力学函数。旋转群的识别可以 通过使用冗余内坐标实现。由于有些结构可能有特殊的成键方式而不能自动 识别,如过渡态,因此冗余内坐标的设置可以用 Geom=Modify 关键词进行修 改。转动涉及的金属需要经过 ReadHinderedRotor 选项(见下)读取附加的 输入部分。  

         如果前一计算产生的检查点文件中有力常数,可以通过指定 Freq=(ReadFC,  HinderedRotor),进行附加的振动/内转动分析。由于 Opt=CalcAll 自动对 优化的结构执行振动分析,因此也可以使用 Opt=(CalcAll,HinderedRotor)。 

ReadHinderedRotor

         读入附加的输入部分,其中包含转动能垒的截断高度(单位 kcal/mol)和可 选的周期性,转动模式的对称性编号,和自旋多重度。能垒高度大于截断值 的转动会自动冻结。如果周期值为负,则也冻结相应的转子。必须对金属所 有可转动的键提供周期性,对称性,和自旋多重度。输入部分用空行终止, 具有如下格式:  

        VMax-value  

        Atom1 Atom2 periodicity symmetry spin    根据需要重复多次 ... 

电子激发分析选项  

以下选项用相应的方法执行电子激发分析;这些任务使用基态和激发态的振动分析,计算两个态之间的电子跃迁振幅。基态振动信息取自当前任务(Freq Freq=ReadFC),激发态的振动信息取自检查点文件,文件名由另外的输入部分提供(如果其中包含空格,则需 要把路径放入引号)。激发态计算可以来自 CIS 或 TD-DFT 的 Freq=SaveNormalModes 计算。  

可以加上 ReadFCHT 选项,读取用于控制计算的附加输入部分(见下),而 SelFCModes 选项可用于选择涉及的模式。对于后者,激发态的检查点文件在典型情况下用 Freq=(SelectNormalModes,SaveNormalModes)产生,并使用同样的模式选择。  

如果 Herzberg-Teller 或 Franck-Condon-Herzberg-Teller 分析中使用 CIS 频率,则必 须用数值方法计算 CIS 频率(Freq=Numer 而不能用 Freq)。这是因为在解析力常数的计算 中,不计算跃迁偶极导数。还需要在基态作相应的 HF 频率计算,可以象通常一样用解析方 法。  

FranckCondon      使用 Franck-Condon 方法[Sharp64, Doktorov77, Kupka86, Zhixing89, Berger97, Peluso97,  Berger98, Borrelli03, Weber03, Coutsias04, Dierksen04, Lami04, Dierksen04a, Dierksen05, Liang05,  Jankowiak07, Santoro07, Santoro07a, Barone09](关于执行的描述,见[Santoro07, Santoro07a,  Santoro08, Barone09])。FC 是该选项的同义词。除了激发分析外,还可以做电离 跃迁分析。对于这种情况,分子说明对应于中性分子,而在输入部分命名的 附加检查点文件对应阳离子。  

HerzbergTeller    使用 Herzberg-Teller 方法[Herzberg33, Sharp64, Small71, Orlandi73, Lin74, Santoro08] (关于执行的描述,见[Santoro08])。HT 是该选项的同义词。  

FCHT           使用 Franck-Condon-Herzberg-Teller 方法[Santoro08]。  

Emission        表示对 Franck-Condon 和/或 Herzberg-Teller 分析模拟发射而不是吸收。这 种情况下,计算中的初态是激发态,末态是基态(但是基态和激发态的频率 数据来源仍然同上:当前任务=基态,第二个检查点文件=激发态)。  

ReadFCHT        读取包含参数的输入部分,用于计算。可用的输入选项在示例后面有说明。 如果同时还指定了 ReadAnharmon,那么这个输入部分优先。  

SelectFranckCondonModes   

              读取输入部分,选择哪些模式用于 Franck-Condon 分析中的差分。这一输入 部分格式的说明见上。如果同时还指定SelectAnharmonicModes,那么这 个输入部分优先,指定的模式按照通常的 Gaussian 顺序(增序),而不是按 照非谐输出部分显示的顺序。SelFCModes 是该选项的同义词。  



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