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MS软件gulp模块中文翻译16-GULP作业GULP作业本节中的主题包括控制和运行远程GULP作业、以独立模式运行作业、示例远程运行的详细信息以及GULP可能失败的势能原因。
使用GULP作业控制Materials Studio在服务器上作为后台进程运行GULP作业。提供了以下工具来设置和控制作业： l 使用GULP“计算”对话框上的“作业控制”选项卡为未来的作业选择网关位置和作业参数。 l 使用服务器控制台应用程序可以添加新服务器并监视多个作业。 l 使用作业资源管理器监视多个作业。 有关使用作业控制的更多信息，请参阅主作业控制和实时更新帮助主题。可以在GULP作业控制选项对话框上请求实时更新。
并行运行GULP作业GULP作业可以在多个计算机内核上并行运行。GULP接口使用Materials Studio的网关框架来提取每个网关服务器的相关信息。您可以选择要使用的核心数量，最高可达可用的最大数量，如控件上并行运行右侧的文本所示。 当GULP并行运行时，并不是所有的功能都可用——特别是，目前对呼吸壳或可变电荷（EEM，QEq）模型的高阶导数的评估没有并行化，也没有对部分场地占用进行并行化。如果GULP检测到设置和并行执行请求之间不兼容，它将提前停止作业。然后将向输出文件[seedname].gout写入一条错误消息，解释冲突的性质。
远程GULP作业GULP使用客户端-服务器体系结构，允许您使用PC控制在远程计算机上运行的计算。 这种客户端用户界面与运行实际计算的服务器系统的分离，使您可以使用高性能超级计算机在Windows台式机上进行计算。它还使您可以利用其他台式机上的备用CPU周期。 GULP作业由Materials Studio在启动作业时生成的输入文件控制。 GULP将计算结果写入各种输出文件，这些文件在作业完成后从服务器下载到相应的Materials Studio项目。
GULP运行示例无论是执行单点能量计算、最小化系统还是执行分子动力学模拟，运行远程GULP作业所执行的步骤序列始终相同。单击“GULP计算”对话框上的“运行”按钮时，将执行示例远程作业运行中描述的步骤，但有以下差异：Materials Studio在从服务器接收更新信息时的确切行为取决于正在执行的计算类型。 对于能量计算，如果 l 已选中更新结构：没有效果，因为没有任何结构更改与此任务关联。 l 已检查更新图形：没有效果。 l 选中更新文本结果：Materials Studio下载一个名为Status.txt的文本文件，其中包含所执行的计算、总能量和总能量收敛的摘要（例如，上一次迭代的更改）。
对于“几何体优化”计算和“表面计算”，如果选中了 l “更新结构”：Materials Studio将下载结构的快照，并相应地修改原始结构的副本。 l 检查了更新图：Materials Studio创建了一个名为[seedname]Energies.xcd的图表文档，显示了总能量与优化步骤的关系，另一个称为[seedname]Convergence.xcd的图文档，以对数尺度显示了总能源变化和梯度与优化步骤的关系。 l 选中更新文本结果：Materials Studio下载一个名为Status.txt的文本文件，其中包含所执行的计算、总能量、总能量收敛（例如上一次迭代的变化）和梯度的摘要。
对于动力学计算，如果选中了 l “更新结构”：Materials Studio将下载结构的快照，并相应地修改原始结构的副本。 l 检查了更新图：Materials Studio创建了一个名为[seedname]Constant.xcd的图表文档，显示运动常数与模拟时间的关系，一个称为[seedname]Energy.xcd的图表文档显示势能和动能与模拟时间之间的关系，另一个名为主[seedname]Temperature.xcd的表格文档显示温度与模拟时间。此外，如果为三维周期性结构运行计算，则会创建图表文档[seedname]Pressure.xcd。当GULP完成平衡阶段时，图表将被清除，并仅显示从那时起的生产阶段结果。 l 检查更新文本结果：Materials Studio下载一个名为Status.txt的文本文件，其中包含执行的计算摘要、完成的动力学步骤数、温度以及最后完成的优化步骤的运动常数。它还说明了GULP目前是否处于计算的平衡或生产阶段。
作业完成后，Materials Studio将把输出文件传输回您的电脑，您可以在那里查看和编辑它们，分析结果，或使用它们进行进一步的计算。根据您执行的计算类型，可能会生成或修改其他输出文件。 l 对于Energy运行，Materials Studio会下载所有GULP输出文件。 l 对于几何体优化运行，Materials Studio下载所有GULP输出文件，更新已复制到结果文件夹中的结构以显示最终几何体，并创建轨迹文件[seedname].xtd，其中包含优化过程的历史记录。可以使用“动画”工具栏上的工具为轨迹文件设置动画。 l 对于动力学运行，Materials Studio下载所有GULP输出文件，更新已复制到结果文件夹中的结构，以在动力学运行开始时显示配置，并创建一个轨迹文件[seedname].xtd，用于描述分子动力学计算的生产阶段。可以使用“动画”工具栏上的工具为轨迹文件设置动画。
如果远程GULP作业失败Materials Studio会在启动前检查执行GULP作业所需的大部分数据和设置。如果无法启动作业，则会生成详细说明原因的错误消息。 但是，有时作业可能会因为无法在启动前检查的原因而失败。在这种情况下，有关错误的更详细信息可能只能在作业生成的[seedname].gout文件或位于服务器端项目目录[seedname]_Files中的MatStudioLog.htm文件中获得。存储在服务器目录中的其他文件，例如Gulp.log，也可能包含进一步的线索。要查看服务器端文件，可以使用作业资源管理器的“远程查看”功能。 以下是GULP作业失败的最常见原因列表。它可以帮助您识别并解决远程GULP作业中的任何问题。有关远程作业失败的一般原因，请参阅“如果远程作业失败”帮助主题。 提示：从菜单栏中选择“查看|项目日志”，查看是否报告了任何错误或警告消息。
GULP作业无法启动的常见原因服务器端问题GULP输出包含一条消息“错误：内存分配失败”。此消息通常意味着运行GULP的计算机上没有足够的可用内存。例如，当要求具有1000多个原子的大型系统具有振动性质时，这很可能发生。通过从GULP设置对话框的性质选项卡中删除振动性质请求，通常可以成功完成运行。 提示：在采取任何行动之前，确定GULP作业失败的原因很重要。在大多数情况下，错误消息会在GULP报告文件[seedname].gout或位于服务器端项目目录[seedname]_Files中的MatStudioLog.htm文件中报告。 |
