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AVOGADRO讲解02-基础介绍Avogadro 是一个分子编辑器，设计用来方便地构建和查看3D分子和材料。它可以在Windows、Linux和Mac上运行。 这本手册主要是在Mac上编写的，但是在任何计算机上的界面都应该非常相似。 当你最初打开Avogadro时，你会看到如下所示的屏幕。 Opening a File你可能想做的第一件事是打开一个文件，在分子周围导航。为此，单击“File”菜单并选择 Open....
然后，您可以查看磁盘上的文件并找到合适的化学文件。由于Open Babel，大量的文件类型被支持，包括CML, XYZ, SDF, Mol2, PDB等。Avogadro提供了几个分子例子。 上面的屏幕截图显示了ethanol.cml文件，打开文件，使用默认的Ball and Stick显示类型显示。注意，当打开一个新文件时，Avogadro会从Draw Tool切换到Navigate Tool，这样你就可以在不编辑的情况下查看分子。 Navigation您可以使用鼠标上的滚动轮来放大/缩小，或者按住鼠标中间的按钮并向上/向下移动鼠标光标。您可以通过按住鼠标左键并移动鼠标光标来旋转视图。您还可以通过按住鼠标右键并移动鼠标光标来转换视图。 注意:如果你的鼠标只有一个或两个按钮，你也可以使用修改键(shift和control)和鼠标左键来执行你通常使用鼠标中右键的动作。 |
