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MS软件gulp模块中文翻译17-在独立模式下运行GULP

在独立模式下运行GULP

运行GULP最方便的方法是通过Materials Studio界面,该界面执行运行GULP作业所需的所有准备任务。然而,在某些情况下,可能需要在独立模式下运行GULP,并在其他地方准备一组输入文件。例如,您可能希望在未配置为网关的服务器上运行计算,例如不与Materials Studio客户端通信的计算机(可能是因为防火墙阻止自动文件传输和作业启动)。

 

生成输入文件

GULP需要一个包含计算详细信息的输入文件。有关此文件的更多信息,请参阅GULP文件格式主题。您可以使用文本编辑器创建此文件,例如Windows上的写字板或Linux上的vi。然而,由于输入文件中包含的信息非常复杂,BIOVIA建议您使用Materials Studio为您生成它。您可以使用GULP作业文件对话框创建所需的文件,有关详细信息,请参阅以独立模式运行作业主题。

 

将输入文件传输到服务器

如果您在服务器机器上使用文本编辑器手动生成输入文件,则不需要文件传输。但是,如果使用Materials StudioPC上生成文件,则必须先将其传输到服务器,然后才能开始计算。

如果无法访问服务器上的硬盘驱动器,则应使用“文件传输”工具将文件从客户端传输到服务器。

 

执行作业

为了帮助您在独立模式下运行GULP,提供了一个名为RunGULP的批处理/shell文件。它可以在GULP可执行文件所在的目录中找到,通常在Materials Studio主目录中的etc/GULP/bin/RunGULP脚本用于在独立模式下启动GULP作业。

RunGULP.sh是为Linux服务器提供的,而RunGULP.bat是为Windows服务器提供的。

 

用法:

RunGULP.sh [-h] [-np number of cores] seedname(Linux)

RunGULP [-h] [-np number of cores] seedname(Windows)

 

选项

说明

-h

显示帮助文本。

-np

指定要在其上运行GULP的核心数量。如果未指定此选项,则使用单个核心。

Number of cores

要使用的核心数量。

seedname

用于标识GULP输入和输出文件集的种子。输入文件应该存在于GULP脚本启动的目录中。

 

从服务器下载输出文件

GULP计算完成后,必须将输出文件传输回电脑,以便在Materials Studio中进行分析。

 

将输出文件传输回电脑

1.使用复制粘贴或文件传输工具将输出文件传输到客户端PC

2.生成的输出文件的完整列表及其内容的描述可以在GULP文件格式主题中找到。所有的文件都应该从服务器上下载。

提示:如果已将文件传输到Materials Studio项目文件夹中,但在项目资源管理器中看不到它们,请尝试使用“刷新”按钮image.png更新项目资源管理局。

 

Materials Studio中打开输出文件

如果您已将正确的文件从服务器传输到PC,并将其存储在Materials Studio项目的文件夹中,则您应该能够使用主题分析GULP结果中描述的GULP分析选项。具体来说,您可以打开包含起始结构的3D Atomistic文档并对其进行更新,创建轨迹文档并设置其动画,或者绘制计算过程中的能量演变。


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