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MS软件gulp模块中文翻译7-设置常规选项

GULP服务器应用程序支持大量设置,其中许多设置可以通过Materials Studio用户界面访问。通过向输入文件添加各种关键字,可以在计算中包括许多其他设置。

一个可能最终决定计算精度的重要设置是力场库的选择。尽管可以在输入文件本身中指定各种原子间交互的细节,但用户界面提供了最简洁的选项。GULP安装中提供了许多forcefield库,下面简要介绍了它们的内容和推荐使用方法。

名字

描述

元素

Belashchenko

Na的嵌入原子法(EAM势能,用于描述液态金属状态。

Na

Brenner

用于有机系统建模的反应键序(REBO势能

C, H, O, F

Brenner1

Brenner REBO势能扩展到碳硅烷。

 C, Si, H

Bresme-H2O

布雷斯梅的水的中心力模型。

O, H

Bush

无机氧化物材料(包括稀土金属氧化物)的壳层模型势能

O, Li, Na, K,

Mg, Ca, Sr,

Ba, Fe, Ti,

Al, Ga, Y, La,

Pr, Nd, Gd,

Eu, Tb, Yb

Carbonates

方解石和相关系统建模的势能。氧气用壳层模型势能表示。

Ca, Mg, Fe,

Cd, Mn, Ni,

Zn, Co, C, O

Catlow

基于Catlow oxygen shell模型势能的收集-建议用于沸石和相关硅酸盐(包括具有羟基的材料)。

O, Mg, Al,

Na, Si, P, H

ClayFF

粘土材料的势能

O, Mg, Al,

Si, Ca, Fe, Li,

Na, K, Cs,

Ba, Cl, H

Cleri-Rosato

用嵌入原子方法(EAM)形式构建的FCC金属的势能

Ni, Cu, Rh,

Pd, Ag, Ir,

Pt, Au, Al,

Pb

Dreiding

有机分子、生物分子和主族无机分子的通用势。

 

H, B, C, N,

O, F, Cl, Br,

I, Al, Si, P, S,

Ga, Ge, As,

Se, In, Sn,

Sb, Te, Na,

Ca, Fe, Zn,

Ti, Tc, Ru

EDIP-carbon

碳与环境相关的相互作用势能

C

EDIP-Si

硅与环境相关的相互作用势能

Si

Ercolessi

嵌入式原子方法的粘合类型实现。

Au

FFSiOH

使用从头计算结果参数化的(羟基化)二氧化硅的壳层模型。

Si, O, H

Finnis-Sinclair

FinnisSinclair的嵌入式原子方法实现。

W, Nb, Ta,

Cr, Mo, Fe,

V

Garofalini

玻璃系统建模的势能,主要是铝硅酸盐。

不使用埃瓦尔德求和,而是使用截断库仑势。不同出版物的切片参数不同,LittonGarofaini1992)的值被认为是决定性的。

Ca, Al, Si, O,

H, Na

Johnson

Johnson的嵌入式原子方法实现。

Cu, Ag, Au,

Ni, Pd, Pt

Lewis

基于Catlow氧气壳层模型势能的氧化物势能的收集。

O, Ca, Sc, Ti,

V, Cr, Mn,

Fe, Co, Ni,

Zn, Zr, Cd,

Hf, Ce, Eu,

Tb, Th, U, Y,

La, Nd, Eu,

Gd, Ho, Yb,Lu, Pu

Matsui

二氧化钛的势能

Ti, O

MEAM-1nn

原始版本的修改嵌入原子势,第一近邻方法。有更准确的MEAM版本涉及第二近邻。

Cu, Ag, Au,

Ni, Pd, Pt,

Al, Pb, Rh,

Ir, Li, Na, K,

V, Nb, Ta,

Cr, Mo, W,

Fe, C, Si, Ge,

H, N, O

MEAM-2nn

涉及第二近邻的MEAM版本。

Cu, Ag, Au,

Ni, Pd, Pt,

Al, Pb, Fe,

Cr, Mo, W,

V, Nb, Ta, C,

Si, Ge, In,

Mg, Ti, Zr,

Li, Ga, N, Ni,

O, H

Mei-

Davenport

在关于自由能和熔化的原始论文中使用的Al的嵌入原子模型。

Al

MOX-fuels

利用从头计算和实验测量构建混合氧化物核燃料的势能

U, Np, Pu, O

ReaxFF 5.5

具有有机分子参数的反应力场ReaxFF

C, O, H

ReaxFF 6.0

反应力场ReaxFF,具有多种有机和无机系统的组合参数。

C, O, H

Zn, O, H

Fe, Cl, O, H

Ni

Ba, Y, Zr

Cu

N

Au, S, C, H

Au,O

Al

Mg, P

Si, Na

ReaxFF Li

反应力场ReaxFF,含Li材料的参数。

C, O, H, N,

S, Li (Mo,

Ni, B, F, P)

Sauer (a)

基于绍尔氧-氧壳层模型势能的收集-建议用于沸石(包括具有羟基的材料)。

O, Si, Al, H,

Li, Na, K

Stillinger-

Weber

硅的Stillinger Weber势能。

 Si

Streitz-

Mintmire

氧化铝的StreitzMintmire可变电荷模型。

O, Al

Sutton-Chen

用嵌入原子方法(EAM)形式构建的FCC金属的势能

Ni, Cu, Rh,

Pd, Ag, Ir,

Pt, Au, Al,

Pb

Tersoff

半导体及其常见杂质的势能

 Si, Ge, C, N,

H, O

Tersoff ZRL

硅、二氧化硅和常见杂质的势能

Si, O, N, H

Tiwary

使用从头计算构建二氧化铀的势能

U, O

Vashishta

专用二氧化硅势能

Si, O

VBO

Al-H系统的价键有序势。

 Al, H

 

Sauer库只能通过QMERA“计算对话框作为QMERA GULP力场使用

注:除非周期系统中静电相互作用的处理外,GULPDreiding力场的实现基本上与Forcete中的等效。为了在GULPForcete之间达成一致,应通过编辑Dreiding.off文件并将DISTANCE_DEPENDENT_DIELETRIC_CONSTANT的值从T更改为F,在Forcete中打开完整的库仑相互作用。该文件存储在客户端和服务器上的share\Resources\Simulation\ClassicalEnergy\FORCEFIELDS\Standard文件夹中-在远程网关上运行Forcete时,必须修改这两个文件。

注:ReaxFF 6.0库包含许多论文中的参数汇编。请谨慎使用此库,因为参数集之间可能存在兼容性问题,并且没有定义元素之间的所有交叉项。Gale2011)对GULP中的ReaxFF实现进行了详细描述。以下是由Gale教授修改的兼容集指南:

ZnOH

FeCl、(OH-OH与相容性论文中的略有不同

Ni、(CH-CH与兼容性论文中的略微不同

BaYZr、(NOH,(OH-OH与论文中的相容性略有不同

SiCNa,(OH.-OH与论文的相容性略微不同

AuS,(CH.OH与本文的相容性稍有不同

 

注:EAM库文件设置为运行涉及单个金属物种的计算。为了研究合金,重要的是要在感兴趣的金属之间添加交叉项。

这些经过验证的力场库随GULP一起提供。许多其他出版物包含了进一步的参数,尽管这些参数不太常用,因此也没有得到很好的验证。伦敦大学学院网站上提供了元素周期表中各种元素的此类势能数据库:http://www.ucl.ac.uk/klmc/Potentials/.

提示:可以将外部源的力场库添加到Materials Studio中。使用“选择GULP力场”对话框可以定位并导入其他力场库。只要文件名的扩展名为.lib,就可以将其导入GULP,并且可以从GULP“计算”对话框的“设置”选项卡上的“力场”下拉列表中进行选择。

或者,GULP允许您通过执行力场拟合运行来生成新的力场或编辑现有的力场。


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