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LAMMPS讲解53-润湿MS+packmol建模所需软件目前市面上充斥着各种建模、模拟、后处理和绘图软件,我们不可能面面俱到,每个软件都会。所以只挑选了几个上手简单,又可以完成相对比较复杂的功能的软件。 建模工具包括Packmol,Material Studio和Atomsk。Packmol(http://leandro.iqm.unicamp.br/m3g/packmol/home.shtml)使用方法非常简单,只需少量脚本就可以建立比较复杂的模型,如下图所示。我们将使用Packmol建立所需形状的各类液滴,比如水滴、离子液滴、溶液液滴等。
Atomsk(https://atomsk.univ-lille.fr/index.php)用于构建具有复杂结构的基底。类似于Packmol,Atomsk同样具有容易上手,脚本简单,功能强大的特点,特别对于各种晶体模型(无论2D或者3D)的建立很方便。在润湿模拟,基底通常具有很多微观结构,使用Atomsk无疑可以达到事半功倍的效果。
Material Studio用于一些简单的建模、模型组装以及加力场,也可以用于可视化出图。 模拟主要靠LAMMPS全家桶,包括lammps主程序以及一些附件工具,如msi2lmp等。
可视化和后处理工具主要包括OVITO和VMD,我们还需要会一些简单的脚本和小程序。
感谢鲍路瑶老师的分享,内容来自于鲍老师分享出来的资料 如有需要添加微信:lmp_zhushou 进入微信群,帮助他人,共建社区 获取完整版lammps讲义可以加微信lmp_zhushou或加入QQ群994359511 该部分由武汉大学阿湖宝博士编写 |