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LAMMPS讲解10- LAMMPS介绍LAMMPS 是一种基于经典力学的分子动力学（MD）代码，用于模拟液态、固态或气态的粒子系统。它可以使用各种原子间势函数（力场）和边界条件，对原子、聚合物、生物、固态（金属、陶瓷、氧化物）、粒状、粗粒化或宏观系统进行模拟。它可以对几千到几百万甚至数十亿粒子的2d或3d系统进行模拟。 LAMMPS可以在笔记本电脑或台式机上编译和运行，但其是专为并行计算机而设计的。它可以在支持MPI消息传递库的任何并行机器上运行。这包括共享内存、分布式内存集群和超级计算机。部分LAMMPS功能还支持OpenMP多线程、矢量化和GPU加速。 LAMMPS是用C++编写的，需要一个至少与C++-11标准兼容的编译器。早期版本是用F77、F90和C++-98编写的。所有版本都可以以源代码形式在LAMMPS网站下载。 LAMMPS旨在易于修改或扩展新功能，例如新的力场、原子类型、边界条件或操作。在最一般的意义上，LAMMPS将一组相互作用的粒子的牛顿运动方程进行积分。单个粒子可以是原子或分子或电子，粗粒原子簇，或介观或宏观材料团块。LAMMPS包含的相互作用大多是短程的，但还包括一些长程作用。 LAMMPS使用邻居列表来跟踪附近的粒子。这些列表针对具有短距离排斥粒子的系统进行了优化，因此粒子的局部密度永远不会变得太大。这与用于模拟等离子体或引力体（例如星系形成）的方法形成对比。 在并行机器上，LAMMPS使用空间分解技术将模拟域划分为计算成本相等的子区域，其中每个子区域分配给每个处理器。处理器与其子域边界的原子通信并存储“ghost”原子信息。此外，还可以使用多线程并行化和带有粒子分解的GPU 加速。
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