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Modeller建模
没用过，因为没有学术账户，以后有时间尝试 Modeller可用于蛋白质三维结构的同源或比较建模。用户提供与目标序列相关的比对序列文件，modeller可自动计算包含所有非氢原子的结构模型。Modeller通过对空间进行约束实现对蛋白质结构的比较建模，并可以执行许多额外的任务，包括蛋白质结构中loop区的从头建模，针对一个灵活定义的目标函数对各种蛋白质结构模型进行优化，蛋白质序列/结构的多重比对，聚类、序列数据库搜索，蛋白质结构比对等。Modeller可安装在Unix/Linux系统、windows和Mac系统中。 |
