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gromacs文件中关于top的解读解读视频链接：终于有时间可以聊点正事~gromacs中的top解读_哔哩哔哩_bilibili ; 后面是解读信息 # 后面才是重要的输入文件 ; Include forcefield parameters 告诉你这个下面要输入力场参数，用include itp文件路径进去 #include "oplsaa.ff/forcefield.itp" 这个是参考格式，表示添加oplsaa.ff目录中的forcefield.itp文件 [ moleculetype ] 表示分子类型 Protein_chain_A 分子类型的名字 nrexcl 多少个原子之内不计算非键相互作用 [ atoms ] 原子名称 nr 原子序号 type 原子类型 resnr 残基序号 |
