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AVOGADRO讲解06-创建分子1.可以使用这个绘画工具来构建和编辑分子。 2.你可以通过左键点击黑色显示来创建一个分子。它会生成一个碳原子。右键单击原子将删除它。
3.左键单击初始原子并拖动鼠标将生成与另一个碳原子的键。
4.Avogadro使用碳作为默认元素。可以通过“Element”下拉菜单选择不同的元素。输入原子符号(例如，砷的“A-s”)是改变所选元素的快捷方式。
5.假设你想创造水。您可以输入“O”，或者从下拉菜单中选择“Oxygen (8)”，然后单击黑色显示。 在已经生成的原子上单击鼠标左键也会改变元素。在这种情况下，点击最初的碳原子会把它变成一个氧原子。
6.如果勾选“Adjust Hydrogens”框，分子中的氢原子将自动调整以满足原子价(如上所示)。
7.键序（Bond order）通过“Bond Order”下拉菜单或键入数字“1”, “2”, “3”来更改。通过左键单击已经创建的债券来添加债券。右键点击一个键会删除键和它所连接的原子。
8.创建二氧化碳: 开始绘制“O-C-O”结构。结构画好后，你所要做的就是点击左键。左键点击将创建一个双键(如图所示)。
9.一旦你创建了你的分子，你可以通过extensions menu优化它的几何形状。选择“Extensions”菜单，并点击“Optimize Geometry”将为您的分子提供适当的键长和角度。
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